76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12924 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  70.83 
 
 
141 aa  224  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  70.83 
 
 
141 aa  224  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  72.66 
 
 
136 aa  220  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  67.12 
 
 
152 aa  219  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  65.25 
 
 
141 aa  200  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  57.66 
 
 
150 aa  166  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  55.56 
 
 
137 aa  149  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  52.21 
 
 
146 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  52.17 
 
 
153 aa  146  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  41.78 
 
 
146 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  34.33 
 
 
143 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  40.58 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  36.03 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  38.14 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  38.14 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  38.14 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  36.84 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  36.59 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  39.17 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  35.77 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  34.96 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  34.96 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  31.47 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  32.54 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  30.82 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  31.34 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  34.07 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  28.68 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  28.37 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  28.36 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  32.33 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  33.6 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  32 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  34.17 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  26.24 
 
 
190 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  34.17 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3181  hypothetical protein  29.14 
 
 
186 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  32.06 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  32.8 
 
 
135 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  28.46 
 
 
163 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  29.51 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  30.53 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  33.87 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2922  hypothetical protein  28.99 
 
 
187 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2908  hypothetical protein  28.99 
 
 
187 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321765  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2878  hypothetical protein  28.99 
 
 
187 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476809  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  24.48 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  28.47 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  31.51 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3701  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  31.61 
 
 
189 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.68 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3917  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  33.59 
 
 
145 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  29.27 
 
 
152 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  28.1 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  28.24 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  25.37 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  28.23 
 
 
179 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4199  hypothetical protein  26.95 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272235  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  26.72 
 
 
450 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  25.98 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  27.5 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  20.9 
 
 
152 aa  42  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  27.5 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  28.33 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  26.19 
 
 
166 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  25.98 
 
 
168 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1359  hypothetical protein  25.6 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  29.93 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  34.33 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  26.61 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  24.41 
 
 
154 aa  40  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>