31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2209 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  327  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  38.41 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  35.29 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  34.65 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  34.65 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  34.65 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  36.59 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  34.09 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  36.22 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  35.56 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  33.85 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  33.85 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  33.85 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  32.14 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  33.08 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  28.47 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  27.91 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.41 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  30.37 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  30.08 
 
 
144 aa  47.4  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  27.27 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  29.75 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  25.75 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  26.4 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  25.37 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  27.64 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  27.69 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.2 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>