53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4178 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  291  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  82.98 
 
 
152 aa  250  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  75.89 
 
 
136 aa  225  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  75.89 
 
 
141 aa  225  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  75.89 
 
 
141 aa  225  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  65.25 
 
 
147 aa  200  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  54.68 
 
 
150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  53.9 
 
 
137 aa  151  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  51.08 
 
 
153 aa  140  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  48.55 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  52.11 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  38.73 
 
 
143 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  36.96 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  35.82 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  39.06 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  39.06 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  39.06 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  41.54 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  35.56 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  38.28 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  30.43 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  32.84 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  31.58 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  35.38 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  32.62 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  36.36 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  28.78 
 
 
190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  32.8 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  32.8 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  32.8 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  29.73 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  29.92 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  28.03 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  30.95 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  30.47 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  30.47 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  32.26 
 
 
153 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3181  hypothetical protein  29.08 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  27.78 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  29.55 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  24.03 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  26.62 
 
 
156 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3720  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  25.95 
 
 
274 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  25.56 
 
 
170 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  29.86 
 
 
189 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.12 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  26.24 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  26.09 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  29.13 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.71 
 
 
139 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  29.92 
 
 
146 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>