33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0753 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  347  6e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  32.7 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  35.67 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  30.82 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  28.77 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  28.77 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.95 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  28.38 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  30.5 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  29.68 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  28.03 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  30.41 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  27.22 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  30.83 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4956  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  29.51 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  27.98 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  26.51 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  27.03 
 
 		 450 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4293  hypothetical protein  42.11 
 
 		 119 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.697042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  28.67 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3776  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.12 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.408818 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4587  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.12 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.892698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  27.78 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0489  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase beta-ISP protein OhbA  29.91 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0235  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.91 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2562  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.91 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2706  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.91 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1576  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.91 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1379  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.91 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0982  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase beta-ISP protein OhbA  29.91 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0204  ortho-halobenzoate 1,2-dioxygenase beta-ISP protein OhbA  29.91 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>