85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4599 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  301  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  57.86 
 
 
142 aa  183  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  58.65 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  58.65 
 
 
140 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  58.65 
 
 
140 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  55.8 
 
 
143 aa  173  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  37.24 
 
 
146 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  44.37 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  37.59 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  40.43 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  38.85 
 
 
143 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  37.31 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  34.33 
 
 
147 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  33.83 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  33.83 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  33.83 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  36.17 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  35.82 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  37.19 
 
 
135 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  35.29 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  37.7 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  37.5 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  29.45 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  31.71 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  28.93 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  34.59 
 
 
190 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  28.93 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  28.93 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  32.12 
 
 
141 aa  60.1  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  37.04 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  30.51 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  28.67 
 
 
154 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  29.63 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  27.42 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  26.95 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  29.69 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  31.25 
 
 
451 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  33.06 
 
 
135 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.46 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  35.87 
 
 
185 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  30.43 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  35.11 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2879  hypothetical protein  27.08 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494384  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  48.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  31.15 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  31.15 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3626  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  31.15 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  27.56 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  27.22 
 
 
167 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  25.76 
 
 
156 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  28.97 
 
 
180 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  26.87 
 
 
189 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  35.29 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  30.95 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  31.71 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  26.5 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  25 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  28.12 
 
 
178 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  27.87 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  27.87 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  29.27 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  27.87 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  32.5 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  35.06 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  29.37 
 
 
151 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  28.36 
 
 
148 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  26.61 
 
 
138 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  28.36 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  28.36 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  24.59 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  32.1 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  27.56 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  25.6 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2766  hypothetical protein  29.7 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  28.41 
 
 
181 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>