54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6762 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  315  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  36.15 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  33.08 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  31.75 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  32.12 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  32.31 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  26.52 
 
 
180 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  30.25 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  28.99 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  27.07 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  28.68 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  30.16 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  29.46 
 
 
181 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2921  hypothetical protein  30.48 
 
 
183 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  24.14 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  26.87 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  27.64 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  30.16 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  28.15 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  26.98 
 
 
185 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3526  hypothetical protein  28.12 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  30.83 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  26.12 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  32.17 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  26.12 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  26.12 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  26.67 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  25 
 
 
168 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0286  hypothetical protein  25.38 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.549587  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0305  hypothetical protein  25.38 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  31.33 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.46 
 
 
187 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  26.56 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  29 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  27.78 
 
 
358 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  26.56 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  30.33 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  26.56 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  30.33 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0390  hypothetical protein  25.98 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.700266 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  29.31 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  29.37 
 
 
145 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  29.37 
 
 
143 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.89 
 
 
146 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  30.15 
 
 
174 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  25.66 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  26.4 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  29.51 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2879  hypothetical protein  25.55 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494384  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  26.4 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  26.4 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  31.43 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  24 
 
 
181 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  23.81 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>