26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3759 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  301  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0390  hypothetical protein  52.48 
 
 
150 aa  150  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.700266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  45.32 
 
 
155 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  45.32 
 
 
155 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  44.6 
 
 
155 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  43.97 
 
 
148 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  41.96 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  36.76 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4010  hypothetical protein  35.46 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  30.66 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  30.51 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  30.51 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  30.4 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  30.51 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  31.11 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  28.46 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  29.85 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  32.23 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4128  hypothetical protein  27.56 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00815835  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  25.37 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  33.82 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  25.98 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  30.25 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  31.43 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  28.33 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3775  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  26.98 
 
 
174 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>