23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3727 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4010  hypothetical protein  45.53 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  36.69 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  36.69 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  36.69 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  35.46 
 
 
145 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  34.29 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0390  hypothetical protein  38.97 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.700266 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  36.76 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  34.09 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  31.11 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  40.68 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  30.66 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0825  hypothetical protein  36.62 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.149035  unclonable  0.00000927167 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  31.62 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  26.97 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  31.03 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  31.03 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  31.03 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  36.59 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  28.67 
 
 
172 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  25.2 
 
 
143 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  29.13 
 
 
141 aa  40.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>