27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2408 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0511  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  34.35 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0326  hypothetical protein  34.51 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1359  hypothetical protein  32.59 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3810  hypothetical protein  35.82 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.258605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  38.02 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  32.8 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  30.58 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  32.52 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4199  hypothetical protein  24.62 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  40.68 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5383  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  26.24 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4529  hypothetical protein  36.23 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  30.07 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  33.88 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  29.85 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1875  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.79 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  28.03 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  42  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  30.95 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  30.95 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  30.95 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  26.36 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  28.8 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>