36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4928 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  292  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  83.69 
 
 
148 aa  243  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  79.85 
 
 
155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  79.1 
 
 
155 aa  220  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  79.1 
 
 
155 aa  220  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  41.96 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0390  hypothetical protein  37.75 
 
 
150 aa  96.7  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.700266 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  35.46 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4010  hypothetical protein  36.67 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  29.1 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  33.85 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  31.01 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  35.48 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  28.89 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  28.89 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  32.52 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  27.34 
 
 
190 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  27.34 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  27.74 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  27.59 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  27.59 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  27.64 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  28.91 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  33.82 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2921  hypothetical protein  31.43 
 
 
183 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  29.37 
 
 
151 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  25.38 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  24.59 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  32.12 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4720  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  37.31 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  25.78 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  34.33 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  26.19 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  34.33 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  34.33 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>