16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2899 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  328  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  32.33 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  37.74 
 
 		 170 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  32.28 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  30.15 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  31.34 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  25.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  30.47 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  30.22 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  29.41 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  43.33 
 
 		 182 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  32.12 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3526  hypothetical protein  28.85 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>