25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7153 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3526  hypothetical protein  46.15 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  44.67 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4750  hypothetical protein  37.06 
 
 		 181 aa  91.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.881143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3367  hypothetical protein  36.84 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4543  hypothetical protein  35.88 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0305  hypothetical protein  38 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0286  hypothetical protein  38 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.549587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0295  hypothetical protein  37.76 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0911  hypothetical protein  32.05 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00698332  normal  0.109988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  33.86 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  34.33 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  28.46 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  32.28 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  27.42 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  30.4 
 
 		 153 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  27.66 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  30.87 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  33.63 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0963  hypothetical protein  30.08 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0759041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>