63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3329 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  46.1 
 
 		 179 aa  123  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  46.27 
 
 		 187 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  40.13 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  41.35 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  41.35 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  38.64 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  38.35 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  39.85 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  38.19 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  36.81 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  33.86 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  32.35 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  31.43 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  35.71 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  31.75 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0375  putative bile acid 7-alpha dehydratase  36.09 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  34.07 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  32.58 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  34.62 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  35.14 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  31.65 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  30.15 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  35.43 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  30.82 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  34.38 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  33.87 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  33.56 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  30.83 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2805  hypothetical protein  28.67 
 
 		 243 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00093788  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  34.96 
 
 		 209 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  35.48 
 
 		 206 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7150  hypothetical protein  31.16 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  29.58 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  33.05 
 
 		 358 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  30.65 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  28.37 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  28.8 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  32.03 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  33.85 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  30.97 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2397  hypothetical protein  28.31 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4291  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.36 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  29.73 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  26.97 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  30.88 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  33.06 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  35.57 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  27.69 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  27.27 
 
 		 190 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1946  hypothetical protein  29.41 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  28.06 
 
 		 192 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  27.4 
 
 		 187 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>