25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1548 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  308  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  48.18 
 
 
166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0375  putative bile acid 7-alpha dehydratase  37.24 
 
 
171 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  36.57 
 
 
156 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  37.04 
 
 
167 aa  84.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  32.26 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  35.43 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  25.69 
 
 
163 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  30.5 
 
 
187 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  29.71 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  27.4 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  31.5 
 
 
162 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  32.59 
 
 
190 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  32.89 
 
 
190 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  31.25 
 
 
209 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  31.01 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  28.28 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5349  hypothetical protein  30.41 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.570428  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3519  hypothetical protein  30.87 
 
 
183 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0333839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2805  hypothetical protein  27.61 
 
 
243 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00093788  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  30.88 
 
 
156 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0963  hypothetical protein  29.25 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0759041  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  30.94 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  28.89 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  31.2 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>