16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3519 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3519  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0333839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5349  hypothetical protein  93.41 
 
 
180 aa  331  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.570428  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3613  hypothetical protein  84.34 
 
 
173 aa  283  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3907  hypothetical protein  83.64 
 
 
173 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.801532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5085  hypothetical protein  81.87 
 
 
177 aa  278  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.6936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2502  hypothetical protein  83.23 
 
 
173 aa  271  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.88856 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0321  hypothetical protein  72.11 
 
 
175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2163  hypothetical protein  64.42 
 
 
171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2101  hypothetical protein  64.6 
 
 
180 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212882  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  44.23 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  44.3 
 
 
172 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  42.94 
 
 
170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0745  hypothetical protein  45.68 
 
 
183 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3899  hypothetical protein  33.91 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3810  hypothetical protein  36.53 
 
 
186 aa  89  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622372  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  30.87 
 
 
151 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>