18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2101 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2101  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212882  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2163  hypothetical protein  86.47 
 
 
171 aa  307  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2502  hypothetical protein  64.67 
 
 
173 aa  225  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.88856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3907  hypothetical protein  65.45 
 
 
173 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.801532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3613  hypothetical protein  64.24 
 
 
173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5085  hypothetical protein  65.06 
 
 
177 aa  214  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.6936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0321  hypothetical protein  68.83 
 
 
175 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3519  hypothetical protein  64.6 
 
 
183 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0333839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5349  hypothetical protein  63.58 
 
 
180 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.570428  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  43.05 
 
 
170 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  43.51 
 
 
172 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  42.59 
 
 
170 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3899  hypothetical protein  38.18 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3810  hypothetical protein  36.47 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0745  hypothetical protein  41.67 
 
 
183 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  27.08 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1470  hypothetical protein  38.24 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0142994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>