16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5349 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5349  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  357  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.570428  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3519  hypothetical protein  93.41 
 
 		 183 aa  331  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0333839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3907  hypothetical protein  84.24 
 
 		 173 aa  283  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.801532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3613  hypothetical protein  83.54 
 
 		 173 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2502  hypothetical protein  81.33 
 
 		 173 aa  275  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.88856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5085  hypothetical protein  82.53 
 
 		 177 aa  274  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.6936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2163  hypothetical protein  64.42 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0321  hypothetical protein  70.75 
 
 		 175 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2101  hypothetical protein  63.58 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  44.23 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  44.23 
 
 		 172 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  42.33 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0745  hypothetical protein  45.57 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3899  hypothetical protein  36.42 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3810  hypothetical protein  35.47 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622372  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  30.41 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>