16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3899 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3899  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  393  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3810  hypothetical protein  44.09 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  42.51 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2101  hypothetical protein  38.18 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2163  hypothetical protein  38.95 
 
 		 171 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  40.85 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  35.63 
 
 		 170 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5349  hypothetical protein  36.42 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.570428  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5085  hypothetical protein  37.87 
 
 		 177 aa  91.7  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.6936 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3519  hypothetical protein  33.91 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0333839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3613  hypothetical protein  35.33 
 
 		 173 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3907  hypothetical protein  34.13 
 
 		 173 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.801532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0745  hypothetical protein  36.56 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2502  hypothetical protein  33.94 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.88856 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0321  hypothetical protein  36.77 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  23.35 
 
 		 156 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>