57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1978 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  325  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  45.68 
 
 		 181 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.47 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  32.45 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  28.36 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  29.17 
 
 		 208 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  25.58 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  25.58 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  25.58 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  32.74 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  33.87 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  27.73 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  34.33 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  27.56 
 
 		 358 aa  47.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  31.76 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  25.93 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  25.76 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3095  hypothetical protein  27.78 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.574385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  28.29 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  29.51 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  32.54 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  30.58 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  24.44 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  28.69 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  29.27 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  29.31 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  29.66 
 
 		 183 aa  43.9  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  30.58 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  30.58 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  28.68 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  32.06 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  24.26 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  24.41 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  27.97 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  27.08 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  26.19 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  26.62 
 
 		 141 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  28.37 
 
 		 192 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  27.56 
 
 		 155 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  30.16 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  26.06 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  31.78 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  31.78 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  23.45 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  26.77 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  26.77 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3899  hypothetical protein  23.35 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  25.93 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  28.76 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.85 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  26.27 
 
 		 135 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  27.14 
 
 		 206 aa  40.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>