26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4856 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  314  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  73.38 
 
 		 145 aa  219  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  77.37 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  72.99 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  73.72 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  73.72 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4293  hypothetical protein  76.27 
 
 		 119 aa  187  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.697042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  36.8 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  31.71 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  28.47 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  30.4 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  28.69 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.08 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  28.24 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  28.24 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1719  hypothetical protein  28.91 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  29.51 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  30.4 
 
 		 168 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  28.89 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  25.98 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  25.78 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  29.32 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  29.17 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>