26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2722 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  36.8 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  32 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  32.06 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  32 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  30.4 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  30.4 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4293  hypothetical protein  33.64 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.697042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  33.62 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  32.28 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.46 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  32 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  30.08 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  31.67 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  33.07 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  31.78 
 
 
146 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2372  hypothetical protein  34.13 
 
 
184 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  35.43 
 
 
135 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  35.43 
 
 
135 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  35.43 
 
 
135 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  30.25 
 
 
129 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1719  hypothetical protein  31.06 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5802  hypothetical protein  30.77 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  32.2 
 
 
141 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  32.46 
 
 
206 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>