15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1461 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  340  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  37.74 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  32.31 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  34 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  31.58 
 
 		 358 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  27.71 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  32.58 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  26.17 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  30.3 
 
 		 133 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  30.37 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  26.19 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  33.06 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  33.08 
 
 		 155 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  28.91 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>