33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3201 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  321  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  45.81 
 
 		 147 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  47.79 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  41.67 
 
 		 163 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  39.86 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  33.54 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  34.01 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  31.37 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2896  hypothetical protein  31.17 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  28.97 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  28.37 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  25.33 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  25.93 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  29.85 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  29.05 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  25.93 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  25.93 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  23.7 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  25.19 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  28.15 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  27.21 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7150  hypothetical protein  30.97 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  31.88 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  26.17 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  28.37 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  26.32 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  24.26 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  24.26 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  24.26 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>