28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3285 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  314  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  42.95 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  35.46 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  33.54 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  32.41 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  31.47 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  33.57 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2896  hypothetical protein  29.14 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  29.93 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  29.93 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  29.93 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  30.15 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  28.17 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  29.85 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7150  hypothetical protein  27.21 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  26.95 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  25.69 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  29.63 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  29.63 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  27.61 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  31.39 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  27.61 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  28.06 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  26.03 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  26.87 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  29.63 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  24.46 
 
 		 166 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  27.13 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>