23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0517 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  38.41 
 
 
147 aa  92.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2896  hypothetical protein  34.78 
 
 
175 aa  92  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  39.86 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  36.76 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  38.64 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  38.64 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  38.64 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  33.57 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  34.01 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  29.45 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  29.41 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  26.24 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  27.4 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  28.91 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  30.83 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  27.69 
 
 
158 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  35.38 
 
 
157 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  26.81 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>