38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0339 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  45.81 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  42.95 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  47.48 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  46.43 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  44.78 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  40.15 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  40.15 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  40.15 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  38.41 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2896  hypothetical protein  35.57 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  35.86 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  30.07 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  29.33 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  32.35 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7150  hypothetical protein  28.37 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  34.07 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  35.07 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  31.85 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  31.29 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  31.06 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  31.06 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.23 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  28.78 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  26.24 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  28.79 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  29.79 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  28.06 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  28.06 
 
 		 159 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09351  conserved hypothetical protein  25.76 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780641  normal  0.027725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  28.79 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  28.46 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  28.03 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  30.94 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  33.71 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0375  putative bile acid 7-alpha dehydratase  28.47 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  41.18 
 
 		 142 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>