34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2758 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  352  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  50.35 
 
 
152 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  31.43 
 
 
450 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.08 
 
 
139 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  25.69 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  25.35 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  29.32 
 
 
139 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  27.78 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  26.52 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  25.9 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  30.83 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  22.96 
 
 
190 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  24.09 
 
 
153 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  30.38 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  24.09 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  23.08 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  27.13 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  28.8 
 
 
358 aa  45.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  28.24 
 
 
187 aa  45.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  25.37 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  23.81 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0320  hypothetical protein  32.2 
 
 
63 aa  44.7  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  29.5 
 
 
185 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  28.79 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1984  hypothetical protein  22.14 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  24.81 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  26.43 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  25.87 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  30.28 
 
 
185 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  30.28 
 
 
185 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  25.56 
 
 
141 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  30.28 
 
 
185 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  25.74 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  35.71 
 
 
162 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>