17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3656 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  46.15 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  40.77 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  32.61 
 
 		 450 aa  70.5  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  35.38 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  34.09 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  29.46 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  32.58 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  31.39 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  30.08 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  24.09 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  28 
 
 		 183 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  27.56 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  29.63 
 
 		 172 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  25.21 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  31.88 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>