36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1786 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  349  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  48.8 
 
 		 221 aa  158  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  30.67 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  35.37 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  36.57 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  25.15 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  31.14 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  35.77 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  40 
 
 		 358 aa  64.7  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  28.4 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  32.52 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  29.2 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  28 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  32.09 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  33.08 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  29.68 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  32.35 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  31.67 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  39.74 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  25.97 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.99 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  29.23 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  32.56 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  32.56 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  32.56 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  36 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  27.88 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  28.67 
 
 		 153 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  36 
 
 		 140 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  36 
 
 		 140 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  29.63 
 
 		 143 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  29.92 
 
 		 158 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  27.78 
 
 		 185 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  25.6 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2450  PEP2-like protein  28.57 
 
 		 222 aa  40.8  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865841  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  27.49 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>