54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0355 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  47.98 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  41.48 
 
 		 185 aa  130  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  40.78 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  37.64 
 
 		 184 aa  104  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  39.39 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  39.39 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  39.39 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  40.24 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  38.24 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  40 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  33.89 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  41.54 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  38.4 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  35.77 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  36.55 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  34.31 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  37.3 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  35.15 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  34.27 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  35 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  35.61 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  32.2 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  29.63 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  29.1 
 
 		 221 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  32.03 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.83 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  30.88 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  27.97 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  30.3 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  39.74 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  26.52 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  29.37 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  29.13 
 
 		 135 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  31.58 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  28.24 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  26.71 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  25.53 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  27.27 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  28.35 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  28.35 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  36.59 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  32.56 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1946  hypothetical protein  33.78 
 
 		 164 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  24 
 
 		 141 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  24 
 
 		 141 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  24 
 
 		 136 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  28.15 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  28.8 
 
 		 133 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  24.29 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  33.68 
 
 		 163 aa  41.2  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>