36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6826 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  47.98 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  44.94 
 
 
185 aa  147  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  38.15 
 
 
185 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  38.15 
 
 
185 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  38.15 
 
 
185 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  36.52 
 
 
184 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  40.28 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  39.31 
 
 
187 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  37.43 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  36.63 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  36.93 
 
 
185 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  39.71 
 
 
178 aa  91.3  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  33.7 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  38.51 
 
 
174 aa  88.6  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  34.25 
 
 
174 aa  84.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  35.86 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  31.71 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  33.12 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  30 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  33.58 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  33.11 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  35.34 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  35.37 
 
 
172 aa  72  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  28.98 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  30.56 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  30.41 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  35.14 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  35.4 
 
 
358 aa  61.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  30.43 
 
 
166 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  27.46 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  25.9 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.78 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  24.81 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  30.3 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  27.66 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>