14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2183 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4230  PEP2 protein-like  72.68 
 
 		 201 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00370  conserved hypothetical protein  41.54 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.316399  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09274  pathogenesis associated protein Pep2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14810)  34.95 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2450  PEP2-like protein  32.26 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865841  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  26.09 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  31.45 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  26.02 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  26.82 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  27.61 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  25.85 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  28.24 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  25.9 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  32.1 
 
 		 143 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>