50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1219 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  35.52 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  34.52 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  34.57 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  31.89 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  36.78 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  33.12 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  35.67 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  33.11 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  28.09 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  34.46 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  29.83 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  28.66 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  30.46 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  32.95 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  29.8 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  29.8 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  29.8 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  32.17 
 
 
135 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  32.17 
 
 
135 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  32.17 
 
 
135 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  31.52 
 
 
183 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  29.5 
 
 
133 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  29.05 
 
 
185 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4230  PEP2 protein-like  29.19 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  30.71 
 
 
137 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  31.58 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  25.68 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  28.48 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  25.17 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  35.11 
 
 
143 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  28.09 
 
 
358 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  26.82 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  25.97 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  23.91 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  32.89 
 
 
151 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.97 
 
 
161 aa  45.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  26.5 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  30.28 
 
 
141 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  29.2 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.99 
 
 
139 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  30.33 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  24.82 
 
 
143 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  26.12 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>