17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4230 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4230  PEP2 protein-like  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  72.68 
 
 		 202 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00370  conserved hypothetical protein  40.7 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.316399  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09274  pathogenesis associated protein Pep2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14810)  34.76 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2450  PEP2-like protein  32.98 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865841  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  32.26 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  30.86 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  29.93 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  28.33 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  26.92 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  27.27 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  29.37 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  29.37 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  29.37 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  23.36 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  25.32 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  24.81 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>