60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3685 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  35.76 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  37.59 
 
 		 182 aa  97.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  34.52 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  30.54 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  32.21 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  32.89 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  40.94 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  32.17 
 
 		 174 aa  87.8  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  39.1 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  37.3 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  39.44 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  41.22 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  29.28 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  35.77 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  31.16 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  35.61 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  35.61 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  35.61 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  34.85 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  34.85 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  31.71 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  34.85 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  36.64 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  32.58 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  35.25 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  35.88 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  32.9 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  32.12 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  36.29 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  30.83 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  32.09 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  31.45 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2450  PEP2-like protein  30.6 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865841  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  29.46 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4230  PEP2 protein-like  32.26 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  28.99 
 
 		 224 aa  50.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  25.93 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  29.93 
 
 		 450 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  26.56 
 
 		 141 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  26.56 
 
 		 141 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  26.56 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  31.11 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  28.68 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  28.99 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  25.55 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  36.22 
 
 		 135 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  36.22 
 
 		 135 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  28.23 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  24.03 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  35.43 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  27.34 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  27.7 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  28.99 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  32.82 
 
 		 135 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  30.89 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.03 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>