63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5494 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  52.98 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  35.47 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  37.08 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  36.26 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  40.28 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  37.59 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  35.52 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  41.67 
 
 		 174 aa  94  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  34.06 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  38.64 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  32.33 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  34.56 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  34.97 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  37.14 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  31.58 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  33.55 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  35.29 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  36.57 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  34.51 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  34.09 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  34.09 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  34.09 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  32.58 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  35.46 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  35.38 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  33.8 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  32.33 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  29.76 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.79 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  30.95 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.2 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.58 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.08 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  31.5 
 
 		 135 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  31.5 
 
 		 135 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  30.71 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  28.15 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  32.31 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  30.14 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  30.53 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  30.66 
 
 		 153 aa  45.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  28.78 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  25.85 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  35.82 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  35.82 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4230  PEP2 protein-like  27.27 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  35.82 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3860  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  35.38 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.705611  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  28.8 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  30.23 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  31.5 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  43.33 
 
 		 161 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  29.2 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  35.16 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  30.67 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  27.4 
 
 		 450 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  28.35 
 
 		 148 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>