42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1169 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  316  9e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  316  9e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  315  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  79.1 
 
 
145 aa  220  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  74.29 
 
 
148 aa  213  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  45.32 
 
 
146 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0390  hypothetical protein  43.8 
 
 
150 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.700266 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  36.69 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4010  hypothetical protein  39.29 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  29.93 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  33.07 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  33.81 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  32.52 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  31.67 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  35.71 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  30.82 
 
 
190 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  30.65 
 
 
160 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  30.43 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  24.81 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  32.28 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  28.24 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  29.41 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  35.82 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2921  hypothetical protein  34.65 
 
 
183 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  27.87 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  27.74 
 
 
138 aa  43.9  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  26.19 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  26.19 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  26.19 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  29.17 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  23.08 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  27.5 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  30.33 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  27.2 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  26.77 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  31.54 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  31.54 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  31.54 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  28.8 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>