28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4216 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  300  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  89.21 
 
 
153 aa  257  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  88.65 
 
 
148 aa  257  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  88.65 
 
 
148 aa  254  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  88.65 
 
 
148 aa  254  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  73.38 
 
 
153 aa  219  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4293  hypothetical protein  77.59 
 
 
119 aa  188  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.697042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  32 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  33.06 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  32 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  33.59 
 
 
147 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  24.81 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  24.81 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  24.81 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  28.37 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1719  hypothetical protein  29.13 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  27.78 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  31.75 
 
 
150 aa  43.5  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  30.83 
 
 
136 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  30.83 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  30.83 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  28.33 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  28.1 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  27.07 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  29.46 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>