32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3750 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  98.65 
 
 
148 aa  302  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  92.09 
 
 
153 aa  267  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  88.65 
 
 
145 aa  254  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  73.72 
 
 
153 aa  207  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4293  hypothetical protein  77.78 
 
 
119 aa  187  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.697042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  30.4 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  32.58 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  29.69 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  28.79 
 
 
190 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  30.15 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  30.3 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  30.47 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  28.91 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  28.91 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  26.61 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  31.88 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  33.85 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  28.12 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  30.58 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  30.71 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  27.13 
 
 
183 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  29.73 
 
 
146 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  28.36 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  29.77 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  25.93 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  25.36 
 
 
135 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>