53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1490 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  83.69 
 
 
145 aa  243  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  75 
 
 
155 aa  213  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  74.29 
 
 
155 aa  213  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  74.29 
 
 
155 aa  213  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  43.97 
 
 
146 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0390  hypothetical protein  42.25 
 
 
150 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.700266 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  34.29 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4010  hypothetical protein  40.41 
 
 
148 aa  77  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.43 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  32.31 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  31.2 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  31.11 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.93 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  27.74 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  29.37 
 
 
190 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  25.56 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  25.56 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  25.56 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  25 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  26.61 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  26.61 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  27.66 
 
 
178 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  26.5 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  27.61 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  26.61 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  30.88 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  30.88 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  30.88 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  25.98 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  28.03 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2921  hypothetical protein  31.53 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  33.88 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  29.63 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  28.46 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  27.41 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  24.62 
 
 
160 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  35.94 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  27.66 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  27.27 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  28.35 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  36.76 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4720  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  37.93 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  26.09 
 
 
141 aa  40.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  30 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  24.81 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  26.19 
 
 
153 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  26.4 
 
 
146 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>