20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1769 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  276  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  37.04 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  37.04 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  37.04 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  29.32 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  32.17 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  26.28 
 
 		 181 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.46 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  31.71 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  29.23 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1946  hypothetical protein  30.16 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2296  hypothetical protein  30.77 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.168074  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4128  hypothetical protein  27.74 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00815835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.24 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  31.01 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  35.94 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  29.71 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>