30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5694 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  316  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  50.35 
 
 		 170 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  30.22 
 
 		 450 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.58 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  32.31 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  23.36 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0320  hypothetical protein  40.68 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  27.54 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1984  hypothetical protein  24.46 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  22.56 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  25.71 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  26.92 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  24.81 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  29.23 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  24.65 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  24.31 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  30 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  33 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  27.33 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3095  hypothetical protein  27.48 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.574385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  24.41 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  20.9 
 
 		 147 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  26.92 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  25.64 
 
 		 358 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  30.69 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  28.46 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  23.44 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  24.09 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  22.22 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>