14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1946 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1946  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  338  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  31.85 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  23.61 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3464  hypothetical protein  30.53 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  26.71 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  30.16 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  29.92 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  28.46 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  33.78 
 
 		 181 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  28.47 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  27.86 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  29.32 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>