59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3634 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  338  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  37.72 
 
 
181 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  36.75 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  36.64 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  32.21 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  37.04 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  28.09 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  31.06 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  35.38 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  29.19 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  32.48 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  29.1 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  33.12 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  33.85 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  30.43 
 
 
184 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  31.25 
 
 
185 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  34.27 
 
 
155 aa  57.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  26.38 
 
 
185 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  25.35 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  30.47 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  29.68 
 
 
172 aa  54.3  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  35.21 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  29.84 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  28.17 
 
 
450 aa  50.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  27.74 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  30.3 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.54 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  31.39 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  29.75 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  30.08 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  25.52 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  28.12 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  28.12 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  28.12 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  28.12 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  28.91 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  29.63 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  24.7 
 
 
177 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  28.46 
 
 
135 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  28.46 
 
 
135 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  26.42 
 
 
358 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  37.97 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  28.8 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  28.47 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.35 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  31.71 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  26.45 
 
 
133 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  31.37 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  26.61 
 
 
136 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1946  hypothetical protein  28.46 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733972  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  26.61 
 
 
141 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  26.19 
 
 
147 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  26.61 
 
 
141 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  22.63 
 
 
145 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  25.98 
 
 
135 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  26.98 
 
 
152 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  28.99 
 
 
137 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>