38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1025 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  35.47 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  35.76 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  33.13 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  34.32 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  33.7 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  33.54 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  31.89 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  32.76 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  37.5 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  37.96 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  34.78 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  30.23 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  34.27 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  32.09 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  29.03 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  27.21 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  32.72 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  28.76 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  33.83 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  31.06 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  31.58 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  31.1 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  31.74 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  29.55 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  32.84 
 
 		 185 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  27.52 
 
 		 450 aa  48.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  31.3 
 
 		 138 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  28.97 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  25.97 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.82 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  26.97 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  25.53 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  26.62 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>