32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5505 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  47.67 
 
 
172 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  33.82 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  35.29 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  29.61 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  30.86 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  29.48 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  27.54 
 
 
174 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  28.24 
 
 
177 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  30.46 
 
 
358 aa  61.6  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.38 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  27.07 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  28.57 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  28.57 
 
 
187 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  30.3 
 
 
185 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  30.77 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  29.61 
 
 
180 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  29.1 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  28.87 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  25.69 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  25.36 
 
 
172 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  29.93 
 
 
161 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  25.58 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  30.08 
 
 
158 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  23.91 
 
 
190 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  27.82 
 
 
139 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  26.87 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  28.46 
 
 
148 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>