37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1570 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  52.98 
 
 		 182 aa  163  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  36.36 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  33.13 
 
 		 180 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  35.67 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  32.17 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  31.93 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  34.25 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  34.31 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  31.71 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  31.72 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  32.43 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  28.65 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  31.71 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  33.55 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  28.67 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  30.41 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  31.14 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  31.55 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  27.54 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  29.1 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  29.19 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  30.08 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  27.91 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  29.27 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  29.01 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  28.98 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  28.17 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  38.24 
 
 		 450 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  30.15 
 
 		 151 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  22.84 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>