42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3920 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  352  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  50.3 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  41.67 
 
 		 182 aa  94  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  35.67 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  38.51 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  31.1 
 
 		 177 aa  88.2  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  39.1 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  31.25 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  36.78 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  34.39 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  35.88 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  35.34 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  33.13 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  34.33 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  35.29 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  34.78 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  38.46 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  36.8 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  33.54 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  32 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  32.48 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  33.56 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.37 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  28.17 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  30.95 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  35.16 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  35.16 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  35.16 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  33.08 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  32.23 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  30.53 
 
 		 358 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  31.82 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  39.47 
 
 		 450 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  30.99 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  27.74 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  27.21 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  26.53 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  26.87 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  29.25 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  27.16 
 
 		 192 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>