19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1484 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  330  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  31.72 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  27.74 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  26.12 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  28.17 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  27.69 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  30.16 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  26.53 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  27.86 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  51.43 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.27 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  28.24 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  25.83 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  25.2 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  26.12 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  23.81 
 
 
190 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  28.12 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  24.82 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  24.83 
 
 
146 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>