56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4369 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  299  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  48.25 
 
 
143 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  52.11 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  50 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  44.37 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  47.06 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  46.32 
 
 
140 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  46.32 
 
 
140 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  46.21 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  44.37 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  46.21 
 
 
136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  46.21 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  45.39 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  43.97 
 
 
142 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  42.66 
 
 
146 aa  103  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  41.78 
 
 
147 aa  103  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  45.39 
 
 
143 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  44.03 
 
 
137 aa  93.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  34.04 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  37.4 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  32.14 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  31.51 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  33.08 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  31.78 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  28.67 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  32.31 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  32.31 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  29.5 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  31.43 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  31.73 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  31.08 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  27.52 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  30.77 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  27.91 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  27.42 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  27.42 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  27.46 
 
 
168 aa  42  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  26.52 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  30.53 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10139  hypothetical protein  25.2 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  40.91 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  24.18 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  29.73 
 
 
148 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  31.88 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  30.37 
 
 
144 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  29.73 
 
 
148 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  29.21 
 
 
145 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  35.16 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  24.83 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  26.92 
 
 
167 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  28.17 
 
 
161 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>